突袭世界的大灾难“第二次冲击”后，世界在废墟之上重建。14岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第3新东京市。本以为能见到父亲迎接的他，却见到名为“使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下，特务机关NERV的葛成
平凡的中学生鹿目圆（悠木碧配音）有一个美满的家庭，在生活中她是个性格温顺又有爱心的好孩子。转学生晓美焰（斋藤千和配音）的出现打破了小圆平静的生活，这个性格酷酷又体弱多病的黑长直少女似乎对小圆有着什么难
13岁的少年刘昴星（田中真弓配音）在料理方面具有极高的天赋，自从母亲去世后，他和姐姐合力经营菊下楼，过着平静自在的生活。然而一个不速之客打破了这一切，母亲的徒弟绍安意图霸占酒楼，经过一番料理对决，阿昴
小新一家还有风间，妮妮，正男，阿呆一起报名动感超人周年纪念南海之旅，就在动感超人电影的船上首映会上，突然出现了一群粗暴的猴子将大人们都掳走了。春日部防卫队为了救出大人们而出动，小新一行人冒险渡海到南海
制作·发行MadhouseStudios原作汤浅政明マッドハウス监督·系列构成汤浅政明角色设计伊东伸高音响监督百濑庆一音乐吉田洁角色-声优表カイバ桑岛法子ネイロ能登麻美子ポポ朴璐美在2004年以剧场版
成为“第三次冲击”元凶的碇真嗣，变得像废人一样……真嗣还能振作起来吗？2012年《福音战士新剧场版：Q》之后，这部动画讲述了被封印的故事的后续。
本片由三段互无关联的故事组成。《她的回忆》：2092年，由伊瓦诺夫领导的太空垃圾回收飞船在返航途中接收到来自“宇宙坟场”的求救信号，特殊的是，信号中掺杂着歌剧《蝴蝶夫人》的唱段。队员汉兹与米格尔前往施
某日，小新（矢岛晶子配音）、小葵和美伢（楢桥美纪配音）被一群神秘人物绑架，醒来之后发现身处一间神秘的基地之内，原来，这里是名为“温泉G组”的秘密组织，意在保护对于日本来说十分珍贵的温泉。然而，横空出世
宁静祥和的见泷原市，全靠魔法少女鹿目圆（悠木碧配音）、美树沙耶香（喜多村英梨配音）、巴麻美（水桥香织配音）以及佐仓杏子（野中蓝配音）守护，一次次击败了人类灵魂深处产生的“梦魇”，全力包围着她们最为珍惜
