小学四年级学生焰莲（坂本真绫配音），和水泽葵、若叶皆实（木村珠莉配音）、神俱土春马（村中知配音）等好朋友合作开发怪物弹珠，经历了一连串前所未有的神奇体验。这一日，焰莲和伙伴们在研究所的地下募集到一条现
奈叶（田村由香里配音）本是一位平凡的小学三年级女生，却因为意外遇见了来自异世界的尤诺而成为了魔法少女，投入到了争夺遗产的战斗之中。在上一次事件结束之后，奈叶告别了与之结下深厚友谊的菲特（水树奈奈配音），重新回归了平静的日常生活，接受着魔力训练，以防备敌人的下一轮猛烈袭击。某日，一个神秘的魔法结界出现在了海鸣市的上空，这不寻常的现象吸引了奈叶的注意。果不其然，奈叶遭到了红发魔法少女维塔（真田麻美配音）的攻击，让奈叶没有想到的是，维塔竟然一下子就破坏了奈叶坚固的防御。所幸菲特及时出现，奈叶才幸免于难，而维塔的
阿米蒂埃和琦莉耶还有她们的家人从小就过着幸福的生活，但随着厄立特里亚慢慢的毁灭，其父患上不治之病而去世。父亲的去世使得琦莉耶受很大的打击，然后琦莉耶开始讨厌其姐姐并对付她。与此同时，奈叶、菲特还有疾风
